При продаже комплекта из прослеживаемых товаров в счете-фактуре надо указывать несколько РНПТ

В счете-фактуре по одному товару заполняется одна строка, и к ней еще множество подстрок, если этот товар — комплект.

Речь идет о комплектах (наборах), в состав которых входят прослеживаемые товары. Например — автоматизированное рабочее место с монитором.

Дело в том, что «жизнь» монитор не заканчивается, даже если он стал частью комплекта. А значит его прослеживаемость не отменяется.

Поэтому при продаже такого комплекта счет-фактура или УПД заполняются в электронном виде.

При этом в новых графах счета-фактуры, содержащих реквизиты прослеживаемости отражаются данные по каждому товару, подлежащему прослеживаемости, включенному в набор.

Для этого заполняются подстроки к строке с набором.

То есть к одной строке счета-фактуры формируются подстроки в количестве, равном количеству РНПТ товаров, подлежащих прослеживаемости, включенных в комплект.

Такое разъяснение дает ФНС в письме № ЕА-4-15/12520@ от 03.09.2021.